Filter Measurements and Plot Data

Gene ID Log2(WT/Mock) Q_WT/Mock P_WT/Mock A_WT B_WT C_WT A_ΔVif B_ΔVif C_ΔVif
HLA-DRB1 -0.18 9.74E-01 9.31E-01 0.17 0.01 0.8 0.17 0.02 0.61
DDX3Y -0.01 9.98E-01 9.95E-01 0.02 0.02 0.87 0.02 0.03 0.95
HLA-A -0.40 9.28E-01 8.30E-01 0.62 0.03 0.03 0.67 0.03 0.04
ALDH1A2 0.10 9.83E-01 9.53E-01 0.63 0.04 0.76 0.78 0.04 1.0
HLA-B -0.70 8.28E-01 6.20E-01 0.13 0.04 0.79 0.16 0.05 0.72
RPS4Y1 0.14 9.74E-01 9.31E-01 0.05 0.06 0.89 0.05 0.07 1.0
VARS2 0.30 9.22E-01 8.17E-01 1.0 0.06 0.18 0.99 0.13 0.15
S100P -1.31 6.39E-01 3.56E-01 0.04 0.06 0.33 0.02 0.02 0.32
HLA-A -0.51 8.56E-01 6.80E-01 0.11 0.06 0.56 0.12 0.08 0.62
HLA-A -0.44 9.01E-01 7.76E-01 0.48 0.06 0.04 0.69 0.05 0.05
HLA-B -0.28 9.40E-01 8.57E-01 0.53 0.06 0.05 0.63 0.05 0.05
HOXB3 -1.01 5.92E-01 3.05E-01 0.13 0.08 0.25 0.37 0.09 0.05
SLF2 -3.11 1.13E-04 3.09E-07 0.09 0.09 0.09 0.08 0.06 0.11
PLEKHD1 -0.41 8.67E-01 6.99E-01 0.11 0.11 0.54 0.12 0.13 0.64
SMUG1 -2.74 4.47E-05 7.11E-08 0.12 0.12 0.15 0.13 0.13 0.09
IFRD1 -1.31 2.01E-01 3.99E-02 0.23 0.12 0.35 0.23 0.16 0.36
APOBEC3C -2.42 5.40E-04 2.27E-06 0.09 0.12 0.13 0.67 1.0 0.91
HLA-DQB1 0.50 8.34E-01 6.32E-01 0.52 0.12 1.0 0.36 0.14 0.72
HLA-B 0.23 9.40E-01 8.58E-01 0.1 0.13 0.93 0.09 0.14 1.0
APOBEC3F -2.01 5.10E-04 1.94E-06 0.15 0.14 0.23 0.86 0.85 1.0
PPP2R5C -2.41 1.53E-05 1.39E-08 0.18 0.15 0.19 0.79 0.85 1.0
APOBEC3G -2.29 1.61E-03 1.57E-05 0.11 0.15 0.17 0.62 1.0 0.84
ESCO2 -2.66 1.53E-05 1.28E-08 0.14 0.16 0.17 0.12 0.15 0.17
GSTT1 0.35 8.84E-01 7.33E-01 1.0 0.17 0.92 0.91 0.15 0.8
PHF11 -2.45 3.31E-05 4.38E-08 0.15 0.17 0.16 0.13 0.15 0.19